Im Winter ist die Höhle bei Eis und Schnee für Besucher geschlossen. Nur erfahrene Höhlenforscher können sie dann begehen - mit Steigeisen. 

Der auf 1711 Metern gelegene Höhleneingang liegt direkt hinter dem Bergbahnhof der Zahnradbahn. Der etwa 500 Meter lange Schauhöhlenteil, den Gäste selbstständig besuchen können, führt bis zum sogenannten Höhlen-Dom. Vier interaktive Themenstationen vermitteln Fakten zur Höhlenforschung. 

Geführte Touren unter fachkundiger Begleitung finden erstmals am 1. Juni statt. Dafür müssen unter www.wendelsteinbahn.de Plätze reserviert werden.

Neben der Wendelsteinhöhle gebe es im Inntal weitere Höhlen zu erkunden, etwa das Grafenloch in Oberaudorf sowie die Tischoferhöhle im Kaisertal.